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2019國自然最全m6A RNA甲基化解析

發(fā)稿時間:2019-08-24來源:天昊生物

一年一度的國自然基金資助項目于上周放榜各大平臺陸續(xù)開始解析國自然項目內(nèi)容,m6A RNA甲基化作為近三年來最火熱的研究方向之一,國自然今年立項數(shù)目更是呈爆發(fā)式增長,天昊生物市場部從多個關鍵詞入手,發(fā)現(xiàn)2019m6A RNA甲基化項目共計179,比2018年增長了一倍之多。

 

從項目類型劃分,重點項目3項,面上項目89項,青年基金81項,地區(qū)基金6項。

 

 

其中部分老師在相應的領域已經(jīng)有m6A相關的重要成果發(fā)表:

 

 

 

從科研單位劃分,共計76個單位拿到了資助項目,中山大學在m6A領域仍然獨占鰲頭,拿到了20項,南京醫(yī)科大學以17項占據(jù)次席,上海交通大學9項,華中科技大學7項,浙江大學6項,武漢大學6項,中南大學6項,哈爾濱醫(yī)科大學5項,同濟大學5項,鄭州大學5項。

中山大學在國內(nèi)一直是m6A修飾表觀領域的領跑者,作為第一單位或合作單位,2019年以來就有近26篇文章發(fā)表,其中包括1Nature (Histone H3 trimethylation at lysine 36 guides m6A RNA modification co-transcriptionally),1Cell Research (Transcriptome-wide reprogramming of N6-methyladenosine modification by the mouse microbiome)1Science Advances (Single-base mapping of m6A by an antibody-independent method),2Nature Communications3Molecular Cancer。

 

 

從研究方向劃分,絕大多數(shù)項目都是與醫(yī)學(健康或疾?。┫嚓P,農(nóng)口相關的項目僅10項。醫(yī)學疾病領域,腫瘤仍然是最主要的方向,約77項,最常見的包括肺癌、肝癌、胃癌、乳腺癌和結直腸癌等。研究的主要內(nèi)容包括m6A修飾如何影響腫瘤的發(fā)生、增殖、轉移、耐藥等。

 

 

其它主要的疾病方向包括心血管疾病(動脈粥樣硬化、心肌梗死、心肌肥大、心肌炎癥等共15項,部分如下圖)、神經(jīng)脊髓相關11項)、骨相關9項)、糖尿病7項)、胚胎發(fā)育分化7項)、孕期疾病4項)、肺部疾病3項)、脂肪代謝3項)、腎臟疾病3項)、膿毒癥2項)、銀屑病2項)等。

 

 

從研究思路上看,今年m6A RNA甲基化最大的特點是非編碼RNA相關的內(nèi)容大幅增加,醫(yī)學相關共計47項!其中主要包括三個研究方向:

1. lncRNAcircRNA本身的m6A修飾

2. m6A修飾影響miRNA的成熟過程(primary miRNAm6A修飾)

3. 非編碼RNA作為上游因子調(diào)控m6A修飾相關的明星分子,從而影響某些mRNA的修飾

 

 

比如m6A修飾影響miRNA的成熟過程,得益于2015年兩項重要的奠基性的成果,1Nature1Cell分別證實了m6A修飾能夠影響miRNA的加工成熟過程以及發(fā)現(xiàn)了pri-miRNA m6A修飾的reader蛋白HNRNPA2B1

 

 

2019年以來國內(nèi)學者在非編碼RNA m6A修飾相關方向也有一些重要成果,如林東昕院士課題組發(fā)現(xiàn)吸煙能夠通過m6A修飾的途徑誘導miR-25-3p的成熟,從而促進胰腺癌的進展,相關成果于20194月發(fā)表在Nature Communications上。

 

 

如中山大學藥學院王紅勝課題組發(fā)現(xiàn)m6A修飾的lncRNA RP11能夠通過翻譯后上調(diào)Zeb1蛋白的表達促進結直腸癌的進展,表明lncRNA的甲基化可能在結直腸癌中發(fā)揮重要作用,相關研究成果發(fā)表在20194月的Molecular Cancer上。

 

 

總結:3年來m6A RNA甲基化修飾在疾病相關的各個領域都有新的重要的發(fā)現(xiàn),m6A修飾確實參與到多種疾病的發(fā)生發(fā)展過程,而調(diào)控m6A修飾的因素眾多,包括多種甲基化修飾酶(writers)、去甲基化修飾酶(erasers)、甲基化修飾識別蛋白(readers)、影響這些酶的上游因子等,同時各種RNA都有可能發(fā)生m6A修飾。因此RNA甲基化方向可以設計多種多樣的方案,特別適合于國自然機制研究的胃口。

 

 

關于天昊

天昊生物具有多年基因組、轉錄組和表觀組等多組學檢測與分析的經(jīng)驗,m6A RNA甲基化作為表觀領域的一大熱點,天昊生物可為您提供m6A整體水平定量,結合RNA-seqm6A MeRIP-seq挖掘潛在的受m6A調(diào)控酶影響的靶點,同時可對靶點進行MeRIP-qPCR驗證。生信團隊亦可提供個性化的數(shù)據(jù)庫挖掘與生信分析內(nèi)容。

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