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【昊閱讀】甲基化水平改變透露產(chǎn)前空氣污染暴露對胎兒健康的影響

發(fā)稿時間:2019-03-13來源:天昊生物


英文題目:Epigenetic marks of prenatal air pollution exposure found in multiple tissues relevant for child health

中文題目:在多種與兒童健康有關(guān)組織中發(fā)現(xiàn)產(chǎn)前空氣污染暴露相關(guān)表觀遺傳標記

發(fā)表時間:2019-02-28

IF7.297 

 

 

研究背景:

  • 產(chǎn)前空氣污染暴露與后代的許多不利健康狀況有關(guān)。然而,目前關(guān)于這些關(guān)聯(lián)的潛在機制知之甚少。
  • 環(huán)境暴露,如空氣污染,可能會通過表觀遺傳機制改變細胞狀態(tài)和人類健康結(jié)果。

研究目標:

探究發(fā)育相關(guān)組織中產(chǎn)前二氧化氮(NO2)和臭氧(O3暴露相關(guān)的位點特異性和全局DNA甲基化(DNAm)變化。此外,我們評估了甲基化是否存在性別特異性變化,以及是否在組織中始終觀察到DNAm變化。


研究方法:

  • 新生兒樣本來自于早期自閉癥風險縱向調(diào)查(EARLI)項目,使用Infinium HumanMethylation450k平臺檢測新生兒的133個胎盤和175個臍帶血標本的基因組甲基化水平。
  • 環(huán)境NO2O3暴露水平是環(huán)境保護局基于EARLI項目母親居住地和AirNOW監(jiān)測網(wǎng)絡(luò),依據(jù)反距離加權(quán)插值法獲得。
  • 我們計算了每個樣本5種基因組區(qū)域中的甲基化水平,包括全基因組區(qū)域,open sea,shelf, shore和島區(qū)域。
  • 對每個基因組區(qū)域進行線性回歸分析;識別每個組織中的與產(chǎn)前O3NO2暴露相關(guān)的差異甲基化區(qū)域(DMR)并調(diào)整技術(shù)和生物變異來源。后續(xù)進行分組分析。

 

研究結(jié)果:

  •  對于O3,暴露增加與臍帶血中open sea區(qū)域和胎盤的shelf區(qū)域DNA甲基化顯著減少有關(guān)(P = 0.00162;P = 0.00028)。
  • 對于NO2,暴露增加與胎盤基因組區(qū)域和島區(qū)域的甲基化降低有關(guān)(P = 0.003)。


 
1.顯示差異的森林圖。對于每種暴露和組織類型,黑色框表示估計的線性回歸系數(shù),即平均十億分之一ppb)暴露增量引發(fā)的DNA甲基化平均變化。 水平線表示每次回歸的95%置信區(qū)間估計。




  • 我們發(fā)現(xiàn)了9個與產(chǎn)前NO2O3暴露相關(guān)的基因座特異性DMR,其中5個是性別特異性的。4個臍帶血DMR位于3個基因:RNF39,CYP2E1PM20D1。5胎盤DMR位于5 基因:ZNF442,PTPRH,SLC25A44,F11RSTK38
  •  最初在臍帶血樣本中檢測到的DMR4個臍帶血DMR),與后期在胎盤中DNAm的暴露相關(guān)變化一致。然而,最初在胎盤中檢測到的DMR5胎盤DMR),在臍帶血中未檢測到DNAm差異,提示這些DMR似乎是組織特異性的。

研究結(jié)論:


我們觀察到與產(chǎn)前NO2O3暴露相關(guān)的全局,基因座和性別特異性甲基化變化。我們的研究結(jié)果支持DNAm是產(chǎn)前空氣污染物暴露的生物學目標,并強調(diào)表觀遺傳參與2種發(fā)育相關(guān)組織中對環(huán)境暴露影響的性別特異性差異易感性。

 

 

-----------------------------重點提示---------------------------------

天昊生物MethylTarget?—多重目的區(qū)域甲基化富集測序技術(shù)

 

 

 

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