【昊閱讀】IF 10分的腫瘤m6A經(jīng)典研究思路分享

發(fā)稿時間：2020-01-22來源：天昊生物

從2018年-2019年的m6A相關(guān)基金已經(jīng)可以看出，短短一年多的時間，m6A的研究主題已經(jīng)從圖譜轉(zhuǎn)向機制，尤其是腫瘤，心血管，免疫，干細胞這四個領(lǐng)域，簡單的圖譜已經(jīng)無法打動基金審核的專家。圖譜+機制的組合研究方案基本上已經(jīng)是這幾個領(lǐng)域5分以上文章的標(biāo)配，今天小編就帶大家閱讀一篇眼科腫瘤的m6A文章，近期發(fā)表在Molecular Cancer雜志上，設(shè)計經(jīng)典，思路清晰，一起來學(xué)習(xí)一下10分左右m6A文章的經(jīng)典研究思路吧。

?   研究目標(biāo)：脈絡(luò)膜黑色素瘤

?   研究團隊：上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第九人民醫(yī)院眼科范先群教授課題組與北京中科院基因所楊運桂教授課題組合作

?   期刊： Molecular Cancer（IF=10.679）

主要研究結(jié)果：

除了提供m6A修飾整體水平定量，m6A圖譜測序，m6A修飾目的基因表達水平定量服務(wù)，

天昊為您的m6A研究思路做個小總結(jié)：

5分以下

思路：2個組別， RNA測序+ m6A-seq，確定m 6A整體水平差異，整體匯報 m6A-seq的修飾圖譜，并且羅列差異表達基因和差異修飾基因。可能需要qpcr驗證找到的差異基因。

5-8分

思路：2個組別，RNA測序+ m6A-seq，確定m6A整體水平差異，整體匯報 m6A-seq的修飾圖譜，并且羅列差異表達基因和差異修飾基因。通過關(guān)鍵甲基化酶的細胞或動物敲降或過表達，結(jié)合后續(xù)的RNA表達譜或RNAseq數(shù)據(jù)變化，來確定受m6A調(diào)控表達的靶基因list；結(jié)合pcr驗證部分靶基因。最好有臨床數(shù)據(jù)結(jié)合分析。

10分左右

思路：除了完成基礎(chǔ)的內(nèi)容，比較關(guān)鍵是確定一個真正參與疾病，并且受m6A修飾調(diào)控的靶基因。核心內(nèi)容包括4各方面：首先要將甲基化酶敲除或者過表達，體現(xiàn)關(guān)鍵甲基化酶表達變化對疾病表型的影響；其次要通過m6A圖譜測序和RNA測序?qū)ふ乙粋€真正參與疾病，并且受m6A修飾調(diào)控的靶基因，并且后續(xù)要利用功能試驗證明靶基因真的與m6A修飾酶結(jié)合并受m6A修飾酶調(diào)控；最后需要將靶基因敲除或者過表達，體現(xiàn)這個關(guān)鍵靶基因表達變化對疾病表型的影響。