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Python入門到底有多簡單(一):數(shù)據(jù)讀寫與輸出

發(fā)稿時間:2020-08-26來源:天昊生物

很多人覺得數(shù)據(jù)分析入門很難,但隨著B站和公眾號上的學習資源越來越多,學習數(shù)據(jù)分析已經(jīng)變得非常簡單。以下面為例,從一張規(guī)則的表格中,根據(jù)門水平名稱,生成對物種門水平的表格文件。



In [1]:

import pandas as pd



讀取文本文件pd.read_table,讀取excel文件,

可以用df = pd.read_excel('*.xlsx',sheet_name='*')。

In [2]:

df = pd.read_table('subsample_otu.tax.0.03.xls')


如下圖所示,門水平有12個門的數(shù)據(jù)。






In [3]:

df['phylum'].unique()
Out[3]:


array(['Acidobacteria', 'Actinobacteria', 'Armatimonadetes',
       'Bacteroidetes', 'Chloroflexi', 'Firmicutes', 'Fusobacteria',
       'Gemmatimonadetes', 'Planctomycetes', 'Proteobacteria',
       'Spirochaetes', 'Synergistetes'], dtype=object)




根據(jù)門水平名稱,提取對應門水平的信息,并生成以門水平名稱命名的Excel文件。

In [4]:

for i in df['phylum'].unique():
    df[df['phylum']==i].to_excel(i+".xls",index=False)
Out[4]:



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作者:大熊

審核:有才

來源:天昊生信團




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